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苋菜AtPAL基因克隆与表达分析

曾林; 黄彬茹; 王晓; 赵春丽; 赖钟雄; 刘生财 福建农林大学园艺学院; 福建福州350002; 福建农林大学园艺植物生物工程研究所; 福建福州350002
苋菜   atpal基因   基因克隆   表达分析  

摘要:[目的]研究苋菜AtPAL基因的功能及在不同非生物胁迫条件下的表达特性。[方法]利用RT-PCR及RACE技术扩增AtPAL基因cDNA全长序列,并对AtPAL基因进行生物信息学分析,同时在不同光质、不同浓度水杨酸(SA)条件下研究AtPAL基因的表达情况。[结果]苋菜AtPAL基因cDNA序列全长为2476bp,包含一个2142bp的开放阅读框,预测编码713个氨基酸。AtPAL基因生物信息学分析结果显示,AtPAL编码蛋白分子量(Mw)为77.4692kD,理论等电点(pI)为6.10;蛋白序列中α螺旋、β转角、延伸主链和随即卷曲分别占51.05%、7.57%、10.80%和30.58%;AtPAL蛋白不含信号肽序列,属于非跨膜蛋白,不含跨膜螺旋区,含有59个磷酸化修饰位点,其亚细胞定位于内质网(E.R)可能性较大。序列对比与系统进化树分析结果显示,AtPAL氨基酸序列与其他物种PAL氨基酸序列具有较高的同源性,并且AtPAL蛋白与菠菜、甜菜、康乃馨3种石竹目物种的PAL蛋白亲缘关系较近。非生物胁迫条件下AtPAL基因表达分析结果表明,蓝光能够有效上调AtPAL基因在苋菜中的表达量;不同浓度水杨酸(SA)的处理下,AtPAL基因在苋菜中的表达量相较于CK对照都呈现上调的变化。[结论]该次克隆的苋菜AtPAL基因属于典型的PAL家族成员,推测在苋菜中该基因可能参与多种胁迫防御反应和激素应答。

简介:《园艺与种苗》(CN:21-1574/S)是一本有较高学术价值的大型月刊,自创刊以来,选题新奇而不失报道广度,服务大众而不失理论高度。颇受业界和广大读者的关注和好评。

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